le/la Post-doctorant(e) sera impliqué dans l'ANR CAMOMILL en interactions avec les autres partenaires du projet. Il aura pour mission de mettre au point les outils de microscopie multi-modale et les méthodes d'analyse croisée des données FCS (fluctuation de fluorescence) et SPT ( Suivie de molécule unique). Il participera avec un étudiant en doctorat à l'application de ces outils dans le suivie de la dynamique des protéines responsable de la régulation de l'ARNP II.
Activités
-Travail sur cellules vivantes marquées en fluorescence
- Réalisation de mesure des dynamique et interactions moléculaire par FCS, SPT et FRET.
- Instrumentation: Mise ne place d'un dispositif de mesure multiplexe
- Réalisation des campagnes expérimentales
- Analyse des données et développent des méthodes associées
- Contribution au développement des méthodes de modélisation
- Présentation des résultats en réunion d'équipe et lors de congrès
- Publications
Compétences
- Autonomie et organisation dans le travail
-Travailler en équipe
- maitrise de l'optique
- Autonomie en microscopie
- maitrise des techniques d'analyse d'image
- Connaissance de base en biologie cellulaire .
Contexte de travail
Le groupe biophotonique Cellulaire Fonctionnelle (Resp. L.Heliot) du laboratoire de Physique des lasers, Atomes et molécules (PhLAM) développe, au sein de l'équipe DySco, depuis plusieurs années des techniques originales d'imagerie moléculaire en cellule vivante par microscopie de fluorescence.
Ce groupe interdisciplinaire (biologie, instrumentation, physique, analyse d'image) développe des techniques pour analyser et quantifier les interactions et dynamiques moléculaire. Nos recherches portent sur l'étude des dynamiques d'assemblage moléculaire au sein de réseaux de régulation. Le/la post-doctorant(e) travaillera sur le projet ANR CaMoMiLL. Ce projet est porté en collaboration avec les équipes de Aymeric Leray (Lab. Carnot, Dijon); Jean-Baptiste Courbot (IRIMAS, Mulhouse). Ce projet à pour objet d'étudier la dynamique de l'ARN polymérase II (ARNP II) et de sa régulation spatiotemporelle dans le noyau. Nous effectuerons des mesures du mouvement de ARNP II et des facteurs de régulation dans le noyau à des échelles spatio-temporelles disjointes (FCS et SPT). Cela nécessite la mise au point de microscope multimode couplant les deux mesures. Les mesures seront analysées par des approches de calcul bayésien approximatif (ABC) et des algorithme d'intelligence artificielle (DL). Les paramètres déduits nous fourniront une quantification multi-échelle des données expérimentales. Nous étudierons la dynamique de ARNP II dans des conditions contrôlées ou perturbées (mutants génétiques, interférence ARN, drogues pharmacologiques) pour comprendre les mécanismes de régulation et à leur remaniement en conditions de stress, ainsi qu'au niveau des mécanismes de régulation de l'horloge circadienne.
Le groupe biophotonique Cellulaire Fonctionnelle (Resp. L.Heliot) du laboratoire de Physique des lasers, Atomes et molécules (PhLAM) développe, au sein de l'équipe DySco, depuis plusieurs années des techniques originales d'imagerie moléculaire en cellule vivante par microscopie de fluorescence.
Ce groupe interdisciplinaire (biologie, instrumentation, physique, analyse d'image) développe des techniques pour analyser et quantifier les interactions et dynamiques moléculaire. Nos recherches portent sur l'étude des dynamiques d'assemblage moléculaire au sein de réseaux de régulation. Le/la post-doctorant(e) travaillera sur le projet ANR CaMoMiLL. Ce projet est porté en collaboration avec les équipes de Aymeric Leray (Lab. Carnot, Dijon); Jean-Baptiste Courbot (IRIMAS, Mulhouse). Ce projet à pour objet d'étudier la dynamique de l'ARN polymérase II (ARNP II) et de sa régulation spatiotemporelle dans le noyau. Nous effectuerons des mesures du mouvement de ARNP II et des facteurs de régulation dans le noyau à des échelles spatio-temporelles disjointes (FCS et SPT). Cela nécessite la mise au point de microscope multimode couplant les deux mesures. Les mesures seront analysées par des approches de calcul bayésien approximatif (ABC) et des algorithme d'intelligence artificielle (DL). Les paramètres déduits nous fourniront une quantification multi-échelle des données expérimentales. Nous étudierons la dynamique de ARNP II dans des conditions contrôlées ou perturbées (mutants génétiques, interférence ARN, drogues pharmacologiques) pour comprendre les mécanismes de régulation et à leur remaniement en conditions de stress, ainsi qu'au niveau des mécanismes de régulation de l'horloge circadienne.