Postée il y a 2 jours
Au sein du PEPR One Water (Eau Bien Commun) qui est un des Programmes et Equipements Prioritaires de Recherche) lancés dans le cadre du Plan d'Investissements d'Avenir (PIA4) par France 2030, pour « Comprendre et innover pour une gestion viable, équitable et durable de l'eau », le projet Projet Ciblé n°8 (OneWater Data) vise à partager, rendre accessibles et compréhensibles par tous, les données sur l'eau.
Dans le cadre des actions portées par l’Infrastructure de Recherche Data Terra et de son pôle de données et de services sur les surfaces continentales THEIA, au sein du projet One Water Data (PC8), l’utilisation de l’outil Galaxy a été initiée. L’objectif est d’acquérir une connaissance de niveau expert de cet outil, d’être le contact principal avec la communauté Galaxy pour le pôle THEIA ainsi qu’avec les partenaires du projet OneWater Data PC8.
La mission de l’ingénieur sera de développer des outils Galaxy principalement à partir des scripts métiers ‘eau’ existants sur la base des cas d’utilisation identifiés au sein des projets OneWater Data et Gaia Data (projet qui vise à développer les services de Data Terra). Ces scripts s’exécuteront sur des ressources numériques eau fournies conformément au FAIR Water Data (OGC, W3C, INSPIRE, RDA, …). Les outils à intégrer concerneront notamment des algorithmes de modélisation hydrologique, hydrogéologiques. L’utilisation de l’outil Planemo, le kit de développement d’outils Galaxy, sur environnement linux en ligne de commande fait partie des outils potentiels. GitHub/GitLab seront utilisés pour les aspects gestion de codes, intégration continues et publication des outils.
Activités
L'ingénieur-e sera rattaché à l’UAR Data Terra et il travaillera en étroite avec la coordination technique de l’infrastructure de recherche Data Terra (pilote de la plateforme d’analyse GAIA-Data) et la coordination technique du Projet Ciblé « plateforme One Water Data ». Il/Elle sera hébergé dans les locaux du BRGM (Orléans – 45). Le télétravail est envisageable dans le cadre des dispositions mises en place par l’employeur. Dans le cadre de ses activités, il/elle participera aussi aux différents événements organisés par le Projet ciblé OneWater Data, le défi qui y est associé et plus largement aux actions menées par le Programme national.
Il-Elle aura pour missions :
- de développer des outils Galaxy sur la base des cas d’utilisation identifiés au sein des projets OneWater Data et Gaia Data (en particulier en lien avec les pôles THEIA, FormaTerre, etc)
- de développer le matériel de formation permettant de comprendre l’utilisation des outils développés.
- de participer aux formations qui seront mises en place sur sites distants à travers l’Europe et il participer à la mobilisation de données eau au niveau national.
- de tester l’application des outils et workflows développés sur les données eau partagées par la OneWater Data Platform et par les pôles de données et de services de l’IR Data Terra (THEIA, FormaTerre, etc).
Compétences
- Connaissance de l'environnement linux en ligne de commande
- Maîtrise des langages de programmation : Python, langage R
- Expérience souhaitée de l'environnement Galaxy et des pratiques d'intégration d'outils dans cet écosystème (ex : utilisation de Planemo)
- Expérience du travail dans un environnement Dockerisé très fortement recommandé
- Intérêt pour la création de matériel de formation sera un plus
- Intérêt pour les données du monde de l'eau. Une expérience en traitement de données hydrologique, hydrogéologique serait un plus
- Intérêt pour participer aux actions de formation sera également un plus
De préférence, être titulaire d'un diplôme de niveau « Master 2 », d'une école ou de l'université dans le domaine des géosciences, de la bio-informatique / informatique
Savoirs :
– Maitrise avancée du langage Python, R etc
– Connaissance de plateformes de développement logiciel de type GitHub/GitLab, Docker
– Connaissance de l'environnement linux en ligne de commande
– Maitrise de l'anglais technique (niveau minimal B2)
Savoir-faire et savoir-être :
- Être force de proposition et autonomie
- Être capable à penser en dehors des chemins établis
- Avoir le goût de l'interaction, de la collaboration et du travail en groupe
- Aisance en expression orale et écrite
- Bonne capacité d'écoute
- Curiosité, créativité
- Intérêt pour la science ouverte
- Culture du service à l'utilisateur
Contexte de travail
L'UAR DATA TERRA a pour mission d'apporter un appui aux activités de l'IR DATA TERRA, des pôles de données et services transverses dans ses missions d’administration et de gestion, de coordination technique et de mutualisation des infrastructures et centres de données et de services et de coordination et portage de projets nationaux, européens et internationaux y compris en direction des pays du Sud. Elle a pour principales tutelles le CNRS, le CNES, IFREMER, l'IRD, INRAE, IGN et Météo France.
Le CNRS est co-pilote du PEPR OneWater - Eau Bien Commun
Ce programme est un des Programmes et Equipements Prioritaires de Recherche) lancés dans le cadre du Plan d'Investissements d'Avenir (PIA4) par France 2030, pour « Comprendre et innover pour une gestion viable, équitable et durable de l'eau ».
OneWater propose une stratégie nationale (Hexagone et Outre-mer) adaptée aux besoins du vivant et des usagers de l'eau, en associant le secteur de l'eau et les acteurs des territoires, afin de consolider le leadership mondial français. Il permet de financer une recherche innovante et structurante pour renforcer les dialogues interdisciplinaires et multi-acteurs, grâce à six défis scientifiques alimentés par différents outils.
Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.
L'UAR DATA TERRA a pour mission d'apporter un appui aux activités de l'IR DATA TERRA, des pôles de données et services transverses dans ses missions d’administration et de gestion, de coordination technique et de mutualisation des infrastructures et centres de données et de services et de coordination et portage de projets nationaux, européens et internationaux y compris en direction des pays du Sud. Elle a pour principales tutelles le CNRS, le CNES, IFREMER, l'IRD, INRAE, IGN et Météo France.
Le CNRS est co-pilote du PEPR OneWater - Eau Bien Commun
Ce programme est un des Programmes et Equipements Prioritaires de Recherche) lancés dans le cadre du Plan d'Investissements d'Avenir (PIA4) par France 2030, pour « Comprendre et innover pour une gestion viable, équitable et durable de l'eau ».
OneWater propose une stratégie nationale (Hexagone et Outre-mer) adaptée aux besoins du vivant et des usagers de l'eau, en associant le secteur de l'eau et les acteurs des territoires, afin de consolider le leadership mondial français. Il permet de financer une recherche innovante et structurante pour renforcer les dialogues interdisciplinaires et multi-acteurs, grâce à six défis scientifiques alimentés par différents outils.
Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.